La sintaxis es tan sencilla como:
diff archivo1 archivo2 > salida.txt
Pero si queremos hacer la comparación entre archivos de diferentes servidores, sin la necesidad de tener que copiar el archivo a uno u otro servidor:
ssh user@hostserver "cat ~/public_html/index.php" | diff - ~/public_html/index.php > diff.txt
Donde compara el archivo index.php del servidor al que hacemos referencia con el "hostserver", obviamente tendremos que tener acceso al servidor donde se encuentra el archivo foráneo.
